Osídlenie čreva baktériami je veľmi dôležité pre obranyschopnosť organizmu. Ak je narušená črevná mikroflóra, môže to viesť k celkovému oslabeniu imunity.
Probiotiká podporujú prirodzenú obranyschopnosť organizmu.

Niektoré z nich navyše obsahujú selén, alebo vitamín C, ktoré prispievajú k normálnej funkcii imunitného systému.